無奈的工藤新一只能依靠在堂弟的懷中，就這樣被他抱著回到了家中。
兩人在浴室內(nèi)清洗一番后，身上帶著剛沐浴過的清香，以及散發(fā)著溫暖的氣息，一起來到一樓的客廳中。
工藤新一更是尷尬看著端坐在旁邊的堂弟，臉上慢慢的流露出害羞的紅暈。
“謝謝你，九歌。雖然我不知道我究竟發(fā)生了什么事，但現(xiàn)在只能接受這種結(jié)果了。我希望你先不要告訴我爸爸媽媽和小蘭，怕他們會擔心我?！惫ぬ傩乱徽\懇的請求著他，看到堂弟點頭后，口中輕輕吹出一口氣。心道：總算解決掉一個。
“小蘭他們擔心你，我就跟了過去。剛到那邊時，剛好看到兩個一身黑衣的人離開那里。想必害你成這樣的，肯定是那兩個人了。要不要我?guī)椭銓ふ宜麄兊嫩欅E?！?p> “暫時先不用，探查他們底細先等一等。免得打草驚蛇，給周邊的人帶來麻煩?！惫ぬ傩乱粚τ谀莾蓚€人閉口不談，從他們與別人交涉的內(nèi)容來看，這兩個人背后肯定有一個龐大的組織。
“現(xiàn)在你變小了，身份怎么解決呢？”工藤九歌看了看坐在旁邊，只有六七歲大小的小孩子，忍不住問出了這句話。
“真是頭疼，實在不行就暫時的居住在阿笠博士那里。想必黑衣人組織也會在工藤家族探查，你這里還是多了幾分危險?！惫ぬ傩乱粚嶋H上最想住的地方，是他的公寓。
“不是很好，阿笠博士畢竟和我們是隔壁。黑衣組織很容易就會查到這個地方，你的身份也沒有那么容易隱藏。要不你就居住到你青梅那里，畢竟那也是一個偵探事務所，更方便你追查黑衣人的底細。你覺得這個怎么樣？”工藤九歌想讓他按照劇情的發(fā)展，居住到毛利事務所。
“你說的也對，看樣子要勞煩阿笠博士出面，給我安排個身份住進事務所內(nèi)?！惫ぬ傩乱煌饬颂玫艿恼f法，兩人便決定一起去阿笠博士的家中。
阿笠博士公寓處于兩個工藤家的公寓中間，出門右轉(zhuǎn)后到了阿笠博士家。
阿笠博士是一名天才的發(fā)明家，總有些稀奇古怪的想法，一些稀奇古怪的物品也在他手中創(chuàng)造了出來。這個老頭兒很宅，幾乎把所有時間都放在了實驗室內(nèi)，此刻他當然在家中。
阿笠博士聽完兩人的敘述后，呆愣愣地坐在一旁。他已經(jīng)被兩人的話語所驚呆了，簡直不可思議，一個成年人被喂了一丸藥丸后，居然縮小到了幼童。如果不是他很熟悉這兩人，還以為別人給他開玩笑呢。
“這群人幕后一定有一個強大的組織，我們的周圍這段時間黑衣人你也可能會監(jiān)視這里。安排他去毛利事務所，對查找黑衣人的線索有一些幫助。另外，博士你幫他設(shè)計一些小東西，能夠讓他應對不必要的麻煩?！惫ぬ倬鸥柘氲絼勇锬切┫∑婀殴值牡谰?，便叮囑阿笠博士幫新一設(shè)計一些。
三人商量好后續(xù)的安排，九歌便帶著新一回到了他的家中。換了合適的衣服，才從更衣室中出來。誰知道不放心的小蘭，這時候卻來到了工藤的家中。
慌亂中工藤新一給自己起的名字為江戶川柯南，至此名偵探柯南的劇情從此刻拉開了帷幕。
工藤九歌照原計劃，拜托了毛利蘭照顧變小的江戶川柯南，表示明天他會去毛利事務所拜訪毛利小五郎。
無奈的江戶川柯南，只得跟著小蘭去了米花町的毛利事務所。
送走了毛利蘭和江戶川柯南，九歌便消失在了自己的房中，一轉(zhuǎn)眼來到了小泉夕子的家中。
他把剛才發(fā)生的一切一一告訴給了小泉夕子，她對今天發(fā)生的所有事情，忍不住好奇起來。在她生活的那輩子，末世來臨后也沒能看到名偵探柯南的結(jié)局，好不容易來到這個世界，當然想看看兒時的偶像。
自認心地善良，正直可愛的小泉夕子決定送柯南一個魔法物品，讓他在遇到案件時，能夠自動觸動魔法屏障，幫他擋去三次物理傷害。她可是記得這個世界很危險，柯南的身邊幾乎每天都在發(fā)生案件，希望這個小東西守護他三次。
兩人決定明天一早就去毛利事務所，約見毛利小五郎。她可對這個表面糊涂，時常被麻醉槍刺中的沉睡小五郎，好奇了很久的。
她肯定是要看看，這個毛利小五郎是否真正是一個糊涂，又不缺乏正義感，熱心腸的一個人。他所表現(xiàn)的好色，嗜酒，邋遢，賭博是否真如他表現(xiàn)出來的那個樣子。
翌日清晨，小泉夕子和工藤九歌相約一起去了毛利事務所。
到了這里后才發(fā)現(xiàn)，昨天晚上他們接到了一件案件，幾人幾乎忙碌了一個晚上。三人正疲憊的躺在客廳的沙發(fā)，毛利小五郎更是斜躺在沙發(fā)上，口中留下可疑的透明物體。
強制打起精神的毛利蘭，接待了他們兩個人。從小蘭的口中得知，昨天晚上他們經(jīng)歷了一件綁架案，到了深夜才回到了事務所中。
兩人在小蘭的陪同下，在事務所中悠閑的等著毛利先生的醒來。小泉夕子從空間拿出一些療傷的藥，讓小蘭幫柯南身上的傷口敷上了一些藥，也讓他昨天被歹徒攻擊所受的傷能夠更快的好了。
工藤新一離開的突然，關(guān)心他的毛利蘭很想從九歌的口中，得知他的下落。
但是工藤九歌在沒有得到新一的批準后，根本不會把他的具體信息告訴她。而且毛利蘭有一種感覺，好像新一就在她身邊，再見到他們兩人后，這種感覺更加的強烈。
時間到了午時，毛利小五郎才慢慢的清醒過來，當發(fā)現(xiàn)事務所中多了兩個和女兒年齡相仿的年輕人。其中一個紅發(fā)的女孩子，更是嬌俏可人，比他的偶像沖野洋子還要漂亮三分。
強忍住心中顏控的沖動，接待了他們兩人。工藤九歌在表明了他的來意后，并且奉上了一張大額支票。
柯南便以阿笠博士以及九歌媽媽的親戚住到了毛利事務所，他則帶著一張金額不小的支票來酬謝毛利小五郎。
平常事務所幾乎沒有客人上門，這也使得毛利小五郎一直處于赤字狀態(tài)，好不容易有一筆金額進賬，他當然會接受柯南的入駐。
毛利小五郎性情高昂的送走了兩位金主，便安排柯南住到了家中。
接下來幾天，柯南被安排進了帝丹小學一年級b班，開始了他小學生涯。
在入學的當天，果不其然的碰到了游樂場中所遇見的三個小朋友。分別是吉田步美，小島元太，元谷光彥，而柯南也在他們的死纏爛打下，終于成為了好朋友。
江戶川柯南不愧為死神小朋友，當他入住毛利事務所后，毛利小五郎接到的案件逐漸多了起來，他也跟著毛利小五郎一起出現(xiàn)在眾多的案發(fā)現(xiàn)場中。只是追查黑衣人組織的信息仍然沒有任何進展，阿笠博士準備的道具也終于送到了柯南手中。
手表麻醉槍，蝴蝶結(jié)變聲器，腳力增強鞋，犯人追蹤眼鏡等讓人看到眼花繚亂，這些小物件雖然制作并不復雜，但對于現(xiàn)在的柯南來說必須具備的小道具。
美滋滋的柯南把這些物品裝配在自己的身上，還高興的到處測試這些高科技物品。
小泉夕子如愿的看到了這些物件，還央求阿笠博士幫他制作了一套，那套能夠變聲器也應她的要求，更換了模版，更方便她來使用。
少年偵探團也得到了阿笠博士的禮物，那個偵探徽章成為了偵探團人手必備的裝備。雖然柯南有時不喜歡那三個小朋友涉及危險，但是他對于新認識的朋友很是關(guān)心。幫他們準備了偵探道具，而且還處處保護他們的安全。
時間一日一日的流逝，從九歌那里得知，死神柯南已經(jīng)經(jīng)歷了數(shù)個案件，幾乎一步一劫，十步一難，案件總會在他身上不經(jīng)意的就發(fā)生了。
天氣漸漸變冷，冬天悄悄的來臨。時間并沒有停止，也不會像動漫中出現(xiàn)今天夏天，明天冬天的情況。終于，小泉夕子他們結(jié)束了一年級的第一學期課程，迎來了寒假。
圣誕節(jié)前夕，很多學校已經(jīng)開始放假了，帝丹小學中的江戶川柯南當然也不例外。
毛利小五郎接到了朋友的邀請，前去參加婚禮。他們?nèi)艘黄鸪俗赂删€前往荊州，少年偵探團以及小泉夕子他們一起跟著去。
在新干線上，柯南發(fā)現(xiàn)了黑衣人的出現(xiàn)，他自然會跟蹤和這兩個黑衣人。
小泉夕子在一旁看著柯南等人的表演，有種處于全息游戲中看著喜歡的劇情。
那兩個黑衣人卻不是伏加特和琴酒，但同竊聽器中聽到了他們要炸掉這條新干線中的一個人，炸彈也會把這條新干線給炸掉。
黑衣人在新主屋站下了車，因為柯南屬于小孩子，告訴新干線上的乘警，但是他們并不相信他。不得已的情況下，他只得獨自去調(diào)查那個手提炸彈箱的那個人。
九歌在旁邊看著他們的表演，用神識鎖定了那個倒霉的交易人。并且打了一個手決，保證那個皮箱不被碰觸而爆炸。