南岸陸軍大勝之余，駐扎在謂源口的清軍水師中的白人虎、段熒器兩位營官奉命帶著十幾艘戰(zhàn)船前往下游蘄州附近巡哨，被鎮(zhèn)守蘄州的太平軍發(fā)現后。
二十九日蘄州太平軍水師當即發(fā)動戰(zhàn)艦百艘前去襲擊清軍巡哨隊，當時太平軍順風揚帆，白人虎二人寡不敵眾遂即溜號，但還是被乘勢出擊的太平軍焚燒巡邏艦一艘，擊損一艘。太平軍艦隊見清軍水師退卻，他們本著人多欺負人少的宗旨，揚帆順風。
猛追十余里，一直追到清軍水師大本營，由于順風追擊的緣故一時間停不下來。此時大本營清軍見狀楊載福、彭玉麟、秦國祿等人隨即各督戰(zhàn)艦長龍，快蟹逆風正面迎擊；哨官任星元、鮑超此時沿著南岸不與交戰(zhàn)先沖到釣魚臺，斷太平軍艦隊退路。
兩支隊伍將沖上來的太平軍百艘戰(zhàn)艦從正反兩面將太平軍艦隊包圍以后，太平軍見后路被截紛紛將船駛向岸邊，以圖等岸逃跑。楊載福等正面迎敵的清軍水師隨即用炮火轟擊逃上岸的太平軍。另一方面妄圖調頭從原路沖一條血路突圍的太平軍，多被從下游包抄上來的鮑超艦隊縱火焚毀。
原來被太平軍追擊的白人虎由于被太平軍苦追十余里，此時得勢沖殺的最猛，不幸被太平軍案件趕來護船陸軍的的抬搶擊中額角，登時殞命。
此戰(zhàn)清軍焚毀太平軍戰(zhàn)艦八十艘，搶奪戰(zhàn)艦十六艘，巨炮六十三尊。
太平軍路上護船水師千人先是擊殺清軍護船水師路上巡哨十余人人，與清軍各營大戰(zhàn)佯裝不敵后敗退，將沖殺最猛的清軍前任江西巡檢石熾然、浙江監(jiān)生徐國本及其清兵誘如林中，伏擊殺害。
太平軍陸軍戰(zhàn)至太平軍艦隊全軍覆沒后無奈撤退。
太平軍此戰(zhàn)失敗后，于初一日業(yè)刮北風正甚的時刻，派出小劃船十余艘行至清軍大本營，亂拋火球妄圖誘使清軍出擊。但是曾國藩認為夜黑風高冒然出擊，風險很高。固急忙傳令軍中“船不開動者，該哨官立即保奏；其開動者，立即革責。”各營哨官聞此殺手锏，都盡量堅壁不動。若有太平軍拋擲火球落于戰(zhàn)艦，立即用水撲滅。
太平軍無奈之下，向清軍艦隊射火箭等物，襲擊一夜僅燒一船。
曾國藩之所以能指揮的動這些悍將，是因為不久前咸豐下旨“曾國藩身負剿賊重任，事權不可不專，自桂明一下文武官員，均歸節(jié)制。倘有不尊調遣，或遷延畏葸、貽誤戰(zhàn)機這，即著該侍郎專銜參奏，以肅戎行。”所以這些將士才如此乖乖聽話。
此后曾國藩在奏折中保奏了此次殉職與出力的白人虎曾國藩為其單獨寫奏折歷數其兩次收復華容縣城，復剿捕巴陵塔市驛賊匪的功績申請以守備撫恤外。另外營官何如海自岳州以來身經數十戰(zhàn)，身先陷陣，奮勇被戕，申請以守備撫恤。前任巡檢石熾然，臂力剛強，膽勇俱壯，因重寡不敵遇害，碎首屠腸，死事最烈，應請飭部議恤。監(jiān)生許國本，襄辦營務，明敏勇敢，即照從九例議恤。
同日上奏的還有一條奏折是寫，詳述武器彈藥損耗過多等等，此地距湖南太遠，湖北又殘破不堪，奏請飭江西巡撫陳啟邁，鑄造彈藥，就近接濟。
從多次曾國藩的奏請我們可以看出，深謀遠慮的曾國藩一直在引導著咸豐帝做事情。
此時，太平軍仍然占據蘄州，田家鎮(zhèn)，富池口，尚有四萬余人，加上江上防線。