當(dāng)細(xì)菌劃線接種到固定平板培養(yǎng)基上后，在適宜的培養(yǎng)條件下。細(xì)菌便迅速生長(zhǎng)繁殖。由于細(xì)菌細(xì)胞受固體培養(yǎng)基表面或深層的限制，故不能在液體培養(yǎng)基中那樣自由打散，因此繁殖的菌體集落，通常稱之為菌落(Colong)。由于平板劃線的分散作用，單個(gè)菌落來源于細(xì)菌的一個(gè)細(xì)胞，生長(zhǎng)一定時(shí)間后便肉眼可見，挑選一個(gè)菌落移種另一固體斜面培養(yǎng)基上，即可獲得細(xì)菌的純培養(yǎng)。
各種細(xì)菌在一定條件下形成的菌落的大小，形狀，光澤，顏色，硬度，透明程度等。所以細(xì)菌菌落特征是細(xì)菌的細(xì)胞結(jié)構(gòu)與生長(zhǎng)行為，如細(xì)菌的夾饃，它的存在與否和菌落形態(tài)等有直接關(guān)系，肺炎鏈球菌因具有夾饃就形成光滑型菌落，其表面光滑黏稠，不具夾饃的菌株形成的菌落為粗糙型，菌落表面干燥，有皺折，表明菌落特征和細(xì)菌細(xì)胞的結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。
菌落的形狀和大小不僅決定于菌落中細(xì)胞的特征，而且也受到周圍菌落的影響，菌落靠得太近，由于營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)有限，有害代謝物的分泌和積累，因而生長(zhǎng)受到抑制。所以在平板分離菌種時(shí)，?？煽吹狡桨迳匣ハ嗫拷木涠驾^小，而那些分散開的菌落均較大。即使在同一菌落中，由于各個(gè)菌落中，細(xì)胞細(xì)胞所處的空間位置不同，在營(yíng)養(yǎng)的攝取及空氣供應(yīng)等方面亦都不一樣，所以在生理上，形態(tài)上或多或少會(huì)有所差異。
在平板培養(yǎng)基上形成的菌落往往有三種情況，即表面菌落，深層菌落和底層菌落，上面所介紹的菌落特征都是指表面菌落。某些菌落在膠培養(yǎng)基中生長(zhǎng)繁殖時(shí)，能產(chǎn)生明膠酶水解明膠。如果將這些菌種穿刺接種在盛有明膠養(yǎng)基的試管中，則由于明膠被水解形成不同形狀的溶解區(qū)，由于特定的細(xì)菌形成一定形狀的溶解區(qū)，所以是細(xì)菌分類的項(xiàng)目之一。
繁殖
細(xì)菌是非常微小又原始的生物，所以它們的繁殖方式及在培養(yǎng)基上的生長(zhǎng)情況與高等動(dòng)植物細(xì)胞有較大的差異。
古細(xì)菌
古細(xì)菌(archaeobacteria)(又可叫做古細(xì)菌或者古菌)是一類特殊的細(xì)菌，多生活在極端的生態(tài)環(huán)境中，具有原核生物的某些特征，如無核膜及內(nèi)膜系統(tǒng)；也有真核生物的特征，如以甲硫酸起始蛋白質(zhì)的合成，核糖體對(duì)氯霉素不敏感，RNA聚合酶和真核細(xì)胞的相似，DNA具有內(nèi)含子并結(jié)合組蛋白；此外還具有既不同于原核細(xì)胞也不同真核細(xì)胞的特征，如：細(xì)胞膜中脂類是不可皂化的；細(xì)胞壁不含肽聚糖，有的以蛋白質(zhì)為主，有的含雜多糖，有的類似于肽聚糖，但都不含胞壁酸，D型氨基酸和二氨庚二酸。
區(qū)別
于病毒的區(qū)別
細(xì)菌和病毒同屬于微生物，只有在顯微鏡下才能看到。但兩者是截然不同的東西。
病毒是一類個(gè)體微小，無完整細(xì)胞結(jié)構(gòu)，由蛋白質(zhì)和核酸組成，必須在活細(xì)胞內(nèi)寄生并復(fù)制的非細(xì)胞型微生物。