7.討論
我們當前對所有尺度生命更深的理解,都正趨向于將決定生命屬性的概念定義在信息上(Nurse 2008),即使它可能并非真的最重要。正如本文已經(jīng)部分回顧那樣,信息理論的工具已經(jīng)被用來解釋各種生物現(xiàn)象,從大腦神經(jīng)元的放電(Honey et al. 2007;Vakorin et al. 2009;Ito et al. 2011;Lizier et al. 2011),到魚群的行為(Butail et al. 2014,2016;Mwaffo et al 2017;Crosato et al. 2018),再到細胞內(nèi)的化學信號傳遞(Chong et al. 2011;Rhee et al. 2012;Selimkhanov et al. 2014)。與此同時,要實現(xiàn)真正的“生命系統(tǒng)物理學”,需要對生命有比目前已知的更基本的理解(Bialek 2012)。其中懸而未決最具挑戰(zhàn)性的問題之一是缺乏區(qū)分生命系統(tǒng)和非生命系統(tǒng)的可量化指標(Clel& Chyba 2002; Davies & Walker 2016)。雖然現(xiàn)代生物學的大部分研究內(nèi)容,可以在沒有對生命是什么(以及不是什么)有深入的數(shù)學理解的情況下進行,但在某些科學領(lǐng)域,客觀的、可測量的生命構(gòu)成標準是絕對關(guān)鍵的:這些標準包括生命的起源和對外星生命的探索(Walker 2017)。在我們努力在實驗室(Cronin & Walker,2016)或其他星球(Walker et al. 2018)尋找新生命實例的過程中,可量化的指標將成為決定性因素——允許在實驗室中設(shè)計可進化的化學系統(tǒng),穿越從非生命到生命的小徑,或允許對生命進行明確探測,即使它可能存在于與已知生命完全不同的化學成分中。
在建立對生命的定量理解方面,最大的障礙之一是我們?nèi)狈m當?shù)目刂苼砀綦x生命過程的物理機制。雖然標準物理學對生命的運作有了一定合理的理解(Schrdinger 1992; Hoffmann 2012),但我們迄今為止還沒有設(shè)計出有效的實驗隔離,證明生物系統(tǒng)和非生物系統(tǒng)屬性是否能夠進行直接比較,或是否能解決非生命和生命系統(tǒng)之間集群行為的差異。亦或許沒有這樣的區(qū)分更有意義。為解決研究生命過程中物理機制需要更好的控制的問題,我們提出了一套想法,建立了一個框架,在這個框架中讓生命存在于一個連續(xù)譜上,從我們目前認為可能表現(xiàn)出一些“類生命”行為的非生命系統(tǒng),一直到行星規(guī)模的文明。這是生命可能存在于一個光譜中想法的自然結(jié)果,在這個光譜中,其中一些系統(tǒng)比另一些更有生命力,關(guān)鍵的區(qū)別屬性是它們的信息架構(gòu)。雖然我們認為這樣尺度的生命可能存在,但還沒能為這種尺度建立適當?shù)亩攘繕藴剩矝]有在上面放置特定的例子。
其中面臨的挑戰(zhàn)之一是,對許多群體系統(tǒng)之間的比較分析仍有待嚴格制定和界定。我們認為信息論方法是最有前途的,因為它們捕捉到了物理系統(tǒng)在時空中存在相關(guān)的因果結(jié)構(gòu),提供了一個足夠抽象和嚴格的數(shù)學框架,是我們發(fā)現(xiàn)生命過程的各種物理介質(zhì)和尺度中量化生命的候選方法。而為了做出群體決策,個體必須共享信息,因此對群體系統(tǒng)中信息流的嚴格量化是可能提供新見解的一種途徑,使人們了解新的計算類型(例如決策)如何從單個代理的行動中產(chǎn)生。
隨著人工智能和信息理論應(yīng)用的發(fā)展,現(xiàn)在可以通過許多不同的渠道提取生物行為的算法來處理生命系統(tǒng)中的信息,例如運動、形態(tài)學和生物電場。然而,盡管在概念和技術(shù)應(yīng)用方面都取得了進展,但尚未進行系統(tǒng)的分析,直接將生命系統(tǒng)的信息特性與非生命系統(tǒng)進行比較,對生命系統(tǒng)的信息特性進行量化。大多數(shù)生物模型都是用硅片樹脂或機器人建造的,這意味著不可能直接將這些模擬系統(tǒng)的物理性質(zhì)與生物系統(tǒng)進行比較,畢竟后者存在于潮濕、混亂的化學環(huán)境中。
這在很大程度上限制了當前人工生命模型區(qū)分表現(xiàn)為“類生命”和嚴格作為生命物質(zhì)的能力。
“一個例子:行為相似但機制不同的跨集體的信息架構(gòu)”一節(jié)中的例子表明,如果它不能捕獲局部級別的規(guī)則,那么不同系統(tǒng)中相同模擬的行為可能是不夠的,因為信息流將有所不同。因此,如果只是天真地構(gòu)建硅片模擬系統(tǒng),可能不足以理解真實生物過程中的物理信息流。我們已經(jīng)證明信息理論對特定規(guī)則選擇是敏感的,而在計算機中建模者會顯式地選擇規(guī)則,這就使得計算機模擬生命中的信息結(jié)構(gòu)與真實世界生物系統(tǒng)相比會直接存在差異。特別是,真實生命不允許孤立系統(tǒng)中的信息流結(jié)構(gòu)(譯注:如封閉的計算機中),不會超越或超出物理和化學法則進行外顯編碼(譯注:如人工智能軟件系統(tǒng)的特殊規(guī)則),我們假設(shè)這是理解生命物理學的關(guān)鍵一步(Walker&Davies 2013)。
此外,計算機模型通常是真實世界過程的低維表示,因此不能捕捉到生物體們處理信息的所有多重信道。向前推進的一條可能道路是建立活體系統(tǒng)的物理模擬。例如,油滴混合物中演化的集體行為提供了一種非生命系統(tǒng)物理中模擬生物特性的方法,而不僅僅是在計算機中模擬(Taylor et al. 2017;Points et al. 2018)。因此,解決我們在這里提出的問題的一條途徑是開發(fā)活體系統(tǒng)的物理模擬,作為探索信息流物理的一種手段。
當然,要確定這種方法是否會最終能取得成果,還有很多工作要做;但我們認為,為理解集群行為,何時可歸因于生命過程、何時又不能,朝這個方向邁出步伐的努力,尤其是研究并提供新的定量理論和工具,將源源不斷提供新的見解并促使生物學持續(xù)發(fā)展。