借助降伏九苗、收納苗疆之恩威，劉琦盡收益州軍民之心，連兵鋒未到的汶山、漢嘉諸郡也傳檄而定。自此以后無論是收編兵馬，還是推行新政，進(jìn)行得都是順風(fēng)順?biāo)?，劉焉劉璋父子?shù)十年的統(tǒng)治根基也隨之煙消云散、無人提及。
至建安八年初，公田制與戶兵制等荊州新政已在益州各郡全面鋪開，由于有荊南各郡血流遍地的前車之鑒在，益州大族不敢有所違逆，紛紛主動認(rèn)購配合，而劉琦也考慮到本土實(shí)際，給予各家酌情轉(zhuǎn)圜，除了那些死硬分子要堅(jiān)決打擊斷根外，對大部分士族土地的收購和征收都留有余地，這讓益州的新政推行出奇順利，除了蔡瑁所在的東川二郡單獨(dú)理政，其余新附各郡共得公田兩萬余頃。其中萬頃設(shè)為公田出租，另萬頃設(shè)為兵屯，可容納戶兵十萬人。
戶兵待遇優(yōu)厚，故應(yīng)募者甚眾，擇優(yōu)招募之下，依舊很快募滿名錄，萬頃屯田分置各處，十余萬精兵列入軍中。鑒于本地兵源充足，除各郡縣看門、收稅、守關(guān)的雜兵外，劉琦計(jì)劃在益州建立兩支強(qiáng)軍，以為將來北進(jìn)關(guān)中、西涼做準(zhǔn)備：
以巴地三郡為主要兵源的鎮(zhèn)巴軍擴(kuò)充到六萬人，由鎮(zhèn)巴校尉甘寧任統(tǒng)領(lǐng)，巴郡太守嚴(yán)顏任副統(tǒng)領(lǐng)，另有零陵邢道榮、孟達(dá)、嚴(yán)朗等人為副將，大寨設(shè)在水陸交匯、交通便利的閬中城，隨時可以北進(jìn)東下。
另以成都所在廣漢郡、北面要地梓潼郡，以及南部、西部諸郡屯兵為兵源，設(shè)立西川軍，大寨常設(shè)在眉山腳下，共募得六萬余人，皆為百里挑一的健壯虎賁，益州降將張翼、冷苞、高沛、楊懷等均納入軍中效力。
廣漢乃益州核心腹地，不容有失，劉琦又調(diào)文武雙全的沮授來成都，既是任益州司農(nóng)，重點(diǎn)推動新政改革，又兼任西川軍監(jiān)軍一職，掌管軍紀(jì)法度，以確保這支軍隊(duì)的紀(jì)律和忠誠。
士兵與副將乃至監(jiān)管都已到位，西川軍主將的人選卻始終懸而未決，同時益州兵馬都督的職位也一直空缺。
鎮(zhèn)巴軍統(tǒng)領(lǐng)甘寧軍功能力均足夠，但畢竟非本地出身，而益州各郡縣乃至屯兵內(nèi)部皆不乏暗流涌動，眼下劉琦雖然領(lǐng)益州牧，但未來的重心肯定會在荊州乃至中原，而不會留在處于大后方的蜀地，故益州除了由張松任長史主掌政務(wù)、沮授任司農(nóng)推動改革外，還迫切需要一名夠分量的人物出任兵馬都督，以統(tǒng)領(lǐng)三軍，震懾宵小。
此人既要威震三軍，又要在本地頗有名望，才能彈壓魑魅魍魎。劉琦思量許久，既聽取龐統(tǒng)、諸葛亮、沮授等心腹謀士的意見，又與張松、法正等益州名士反復(fù)商定人選，最終一致認(rèn)為除前益州護(hù)軍黃權(quán)黃公衡外，再無他人足以勝任。
然此時黃權(quán)已只身回了閬中老家，在鄉(xiāng)間草堂耕讀度日，劉琦數(shù)次去書相邀，又派法正為使求訪，皆被以年老氣衰、不堪征戰(zhàn)為由婉拒，最后只能由劉琦親赴閬中，并擺足禮儀，多次登門拜見，留下三顧草堂的佳話。
期間劉琦袒露心胸，講明政策，承諾要為耕者有其田、居者有其屋而戰(zhàn)，這才最終打動黃權(quán)，愿為此宏圖而效勞，出山任益州兵馬都督兼西川軍統(tǒng)領(lǐng)之職。
至此益州軍政架構(gòu)搭建完畢，境內(nèi)政通人和，水土豐茂，同時北有蔡瑁屏障戎狄，南有九苗統(tǒng)領(lǐng)諸蠻，成為繼荊南四郡后又一源源不斷為劉琦提供兵馬糧秣的戰(zhàn)略基地。
除此以外，留駐東川漢中的蔡瑁也已主動上表臣服，當(dāng)然前提是內(nèi)政軍務(wù)方面的相對獨(dú)立。劉琦也明白不必急于一時，欣然接受了蔡瑁的條件，封其為東川中郎將，領(lǐng)漢中、上庸兩郡太守印綬，并慫恿其繼續(xù)北上，攻略關(guān)中、西涼諸州郡。
俗話說金角銀邊草肚皮，當(dāng)益州平靖，九苗拜服，整個西南方向再無戰(zhàn)事后，荊州這塊四戰(zhàn)之地便有了一塊穩(wěn)定的角邊作為根據(jù)地和大后方，劉琦也得以騰出手來回到大溪城，調(diào)集糧秣，整肅軍馬，修葺戰(zhàn)艦，各支部隊(duì)也募集新卒、擴(kuò)充兵力，準(zhǔn)備待合來年開春后覓機(jī)東下，將茍延殘喘的東吳勢力一舉蕩平。
建安八年二月，春水初暖，好消息傳到江陵——被派去嶺南的劉備攻陷了交州州治廣信城，交州刺史張津逃往番禺，被手下斬首獻(xiàn)城，劉琦有意無意間布下的這一著閑棋終于派上了大用場。
原來劉備被派去交州后，張津也知其名望，故而高度重視，派出手下大將、南越首領(lǐng)士燮率南越土軍前去迎戰(zhàn)。
南越土軍擁有本土作戰(zhàn)戰(zhàn)力極強(qiáng)的象兵、戰(zhàn)力明顯占優(yōu)，而劉備并未魯莽用強(qiáng)，而是先示之以弱，避戰(zhàn)不出，買通當(dāng)?shù)赝林?，摸清了象兵的底?xì)和弱點(diǎn)后，再采取誘敵深入之策，在大山中以弓矢檑木伏擊南越土軍，南越首領(lǐng)士燮被關(guān)羽一刀劈死，所部象兵也被殲滅殆盡，余者皆逃往交趾深山密林之中，南越土著再不成軍。
南越土軍被殲，張津頓失一大臂膀，尚來不及調(diào)兵遣將，劉備便已兵出神速，圍攻州治廣信城。廣信城兵少將寡，張津不敢死守，選擇棄城而逃，只數(shù)十騎連夜退往番禺。到了番禺后無兵無卒的張津還想作威作福，結(jié)果被番禺本地大族出身的縣令步鷲誘殺，首級直送往劉備軍中。
土越南遁，張津身死，州治又失，交州其余郡縣更是斗志盡喪，很快便被逐一擊破，各州郡皆投，劉備大軍順勢北上，直逼東吳腹地會稽，迫使原本重兵死守秣陵石頭城的東吳都督周瑜不得不分兵應(yīng)對，這既讓本就緊張的東吳兵馬更加捉襟見肘，更是讓孫權(quán)與在會稽有著諸多利益的四大家族之前步調(diào)不一、矛盾加劇，秣陵防線雖然看起來依舊重兵屯守、堅(jiān)不可摧，但劉琦已敏銳看到戰(zhàn)機(jī)的到來，遂決定起兵東征，親自敲響東吳的喪鐘。