5月份的江南，氣溫漸漸升高，連綿小雨已經(jīng)下了整整一天天，所有的道路都變得泥濘不堪，城內(nèi)的士兵因擠在潮濕的城墻內(nèi)苦不堪言幸好吃的還是熱乎的勉強(qiáng)能忍受，城外的士兵就更慘了，下雨天進(jìn)攻本就困難，還要被營(yíng)寨的士兵在夜晚騷擾，只盼望著能早日結(jié)束戰(zhàn)爭(zhēng)。
1644年5月24日拂曉，方國(guó)安、陳子龍按照朱慈烺的安排開(kāi)始了進(jìn)攻，這次城內(nèi)只留下一萬(wàn)守軍兵鋒直指阮大城的軍隊(duì)，方國(guó)安的軍隊(duì)從北門殺出去，陳子龍的軍隊(duì)從營(yíng)寨也往北門趕來(lái)，初戰(zhàn)時(shí)在前后夾擊下，數(shù)量相差無(wú)幾的阮大城和劉良佐軍隊(duì)被打的節(jié)節(jié)后退，阮大城心中疑惑不解，心想：朱慈烺的軍隊(duì)是怎么敢出城的，明明是自己人多，難道是城內(nèi)已經(jīng)存糧了，但這才圍住了四天，也不敢大意，立馬將所有的軍隊(duì)召集起來(lái)，正好他們也不想拖延了打個(gè)決戰(zhàn)。
戰(zhàn)至晌午，對(duì)方將領(lǐng)也不敢馬虎大意，開(kāi)始調(diào)整陣線相互配合起來(lái)，朱慈烺的軍隊(duì)因多是新兵漸漸落入了下風(fēng)，阮大城的軍隊(duì)損失不過(guò)兩三千人，朱慈烺的軍隊(duì)損失有五六千人。
忽有一支軍隊(duì)從西面殺過(guò)來(lái)，方國(guó)安和陳子龍臉上緊繃的表情漏出了笑容，他知道，是他們的援軍到了，隨即大喝一聲“叛臣阮大城，我們的援軍趕來(lái)了，你還不快下馬受降”，阮大城冷哼了一聲不再理會(huì)，他又不是瞎子那么多軍隊(duì)填了進(jìn)來(lái)他看得見(jiàn)，但他不能退縮，他一退劉澤清和劉良佐的軍隊(duì)肯定跑的比他還快，而且戰(zhàn)敗了回去就再也沒(méi)有機(jī)會(huì)翻身搞不好還得被問(wèn)責(zé)。
阮大城不得已把劉澤清、劉良佐招過(guò)來(lái)議事，平復(fù)了心情問(wèn)道“各位將軍，如今我們的軍隊(duì)被三路包夾，都有不小的損失，后面的仗我們應(yīng)該怎么打”，劉良佐和劉澤清一聽(tīng)這話都面面相覷，你作為一個(gè)總督師都不清楚怎么打，我們又能有啥辦法，劉良佐此時(shí)的部隊(duì)還剩下一萬(wàn)八千，他并不打算把家當(dāng)都都在這里拼光“阮尚書，隨著敵方援軍的到來(lái)，我們目前劣勢(shì)很大，逃跑的士兵絡(luò)繹不絕，攔都攔不住，不如我們?cè)琰c(diǎn)撤退吧，搞不好會(huì)全部折損在此，我們的性命都危險(xiǎn)了”，阮大城只得無(wú)奈的同意了“就算要撤退也得要想個(gè)萬(wàn)全之策，不然敵方人數(shù)眾多死死咬著我們，很難安全撤退”，劉澤清在之前被打的打敗以后早就想跑了，他只有兩三千人，這些都是自己的心腹，再打就要死光了，便率先開(kāi)口道“阮尚書，我以為打了一天了雙方士兵都很疲憊，可以在晚上乘著夜色緩緩撤退，就不怕敵方追擊了”，三個(gè)人都覺(jué)得這么說(shuō)有道理就同意了，，當(dāng)何騰蛟的軍隊(duì)很快趕到了戰(zhàn)場(chǎng)，阮大城、劉澤清、劉良佐都知道在這么打下去毫無(wú)優(yōu)勢(shì)，但也不敢立馬撤退會(huì)造成大奔潰，只能咬牙堅(jiān)持，幾個(gè)人商量堅(jiān)持到半夜就可以乘著夜色撤軍回南京。
到了傍晚，阮大城的軍隊(duì)又損失了七八千人，此時(shí)只剩下了五萬(wàn)人，朱慈烺的參戰(zhàn)人數(shù)則來(lái)到了9萬(wàn)多人，阮大城、劉澤清、劉良佐的軍隊(duì)被擠壓在中軍大營(yíng)之中，隨著南京城陷落、朱由崧兵敗被殺的消息傳到了阮大城的耳中，眾人皆是震驚，隨之而來(lái)的就是恐懼，因?yàn)樗麄儾粌H被包圍，還回不去了，頓時(shí)亂做了一團(tuán)，劉澤清和劉良佐憑借以往逃跑的經(jīng)驗(yàn)各自奔向自己大本營(yíng)，阮大城慌不擇路被殺死在亂軍之中，何騰蛟和陳子龍便各自帶領(lǐng)一萬(wàn)精銳騎兵追了上去。
朱慈烺這邊在收到錦衣衛(wèi)傳回來(lái)的捷報(bào)，立馬派黃得功對(duì)劉澤清、劉良佐的軍隊(duì)進(jìn)行圍追堵截陳子龍乘勢(shì)，朱慈烺則從南京出兵帶兵殺向?qū)巼?guó)府、松江府、上海、蘇州、鎮(zhèn)江，因朱由崧被殺的消息早已天下皆知，沿途并沒(méi)有遇到什么抵抗，方國(guó)安則派自己的兒子方元科率兵進(jìn)攻溫州、湖州、寧波、金華。
劉澤清在逃跑到徽州府路上被何騰蛟帶兵趕上，五六千只余百名近衛(wèi)，在走投無(wú)路的時(shí)候想要投降并愿意獻(xiàn)出自己的全部城池，只希望放他回去，但是何騰蛟早已收到了朱慈烺的命令俘虜或者斬殺，劉澤清知道自己以前在崇禎皇帝手下時(shí)候，并不服從朝廷命令，如果當(dāng)了俘虜并沒(méi)有什么好的下場(chǎng)便當(dāng)場(chǎng)自盡了。劉良佐帶領(lǐng)一萬(wàn)雖然跑的很快，但在廬州府附近就被黃得功攔住了，后面還有陳子龍的軍隊(duì)在追殺，很快就被包圍了，在亂戰(zhàn)中被殺死，剩余的部隊(duì)能跑的都跑了，被俘虜?shù)钠咔恕?p> 在清理了劉良佐和劉澤清的部隊(duì)以后，朱慈烺帶領(lǐng)南京四萬(wàn)人，黃得功兩萬(wàn)人進(jìn)逼徐州，高杰感到非常害怕向朱慈烺寫信書表示自己愿意歸降。朱慈烺知道他只是假意歸降，等清朝打過(guò)來(lái)了，他絕對(duì)會(huì)第一個(gè)投降，于是就告訴他接受了他的歸降，但是需要他親自到南京重新任命，高杰也沒(méi)有多想，覺(jué)得就像擁立弘光帝一樣，只是換了個(gè)主子而已。隨著高杰到了南京城便被朱慈烺直接殺了，徐州、泗州因沒(méi)了主帥便亂作一團(tuán)，高杰的幾個(gè)兒子互相爭(zhēng)權(quán)奪利，剩下的將領(lǐng)有的想依附清朝，有的想投靠到左良玉的麾下，清朝還在陷入跟大順的戰(zhàn)事里并不想進(jìn)行兩線作戰(zhàn)便沒(méi)有理睬，左良玉在得知了江南的亂戰(zhàn)，他也正好面臨著被大西政權(quán)和大順軍的來(lái)回攻打的風(fēng)險(xiǎn)便同意了他們的請(qǐng)求，讓親信通知他們?nèi)恐浦齑葻R的軍隊(duì)，自己帶領(lǐng)十萬(wàn)大軍號(hào)稱五十萬(wàn)，但左良玉這支軍隊(duì)只有一萬(wàn)多人是左良玉的嫡系，原先的精銳部隊(duì)早在與李自成的拉鋸戰(zhàn)中損耗殆盡，其余都是在武昌剛招募的戰(zhàn)斗力低下的流民，以鏟除假太子的名義，發(fā)布檄文，帶兵討伐朱慈烺。