第一百零五章 生命禁區(qū)
果然,一切都充滿“驚喜”。
邁過(guò)那道加大加寬的黃色屏蔽門后,映入眼簾的是四個(gè)紅色大橫幅,上面寫(xiě)著:
頭上懸著三把劍:
如何逆轉(zhuǎn)非編碼區(qū)基因變異進(jìn)程?
腺病毒究竟如何通過(guò)影響非編碼RNA影響植物?
倒計(jì)時(shí)2555天。
盧赫掐著指頭算了算,2555天差不多是7年。
不是還有13年嗎,怎么還縮水了呢?這可不是什么好消息。
滿腹狐疑地經(jīng)過(guò)那套熟悉的復(fù)雜流程,他來(lái)到了實(shí)驗(yàn)室內(nèi),明亮的燈光刺得他睜不開(kāi)眼睛。
這些鑲嵌在吊頂上的巨大燈管,散發(fā)著一種奇異的色彩。他很久沒(méi)見(jiàn)到過(guò)如此通透的白色了。
適應(yīng)了光線之后,他發(fā)現(xiàn)在一排空蕩蕩的生物安全柜前站著一個(gè)熟悉而陌生的身影,正抬頭直視著頭頂?shù)臒艄?,看得很入神?p> 他悄悄走過(guò)去,繞到對(duì)方側(cè)面,果然是一張熟悉的臉。
“你又挺過(guò)來(lái)了?可喜可賀啊?!彼滩蛔≌{(diào)侃道。即便在知道事情原委之后,他早已對(duì)曾經(jīng)把他給折騰不輕的事情釋然了,但面對(duì)眼前的枯槁小老頭,還是沒(méi)忍住。
對(duì)方?jīng)]有回應(yīng)他,依然抬頭望著燈,自顧自地說(shuō):“看到這些純白色的燈了嗎?多么純凈的顏色?!?p> “日光燈誰(shuí)沒(méi)見(jiàn)過(guò)?汞蒸氣產(chǎn)生紫外光,紫外光轟擊熒光粉后的二級(jí)光子,就是純凈的白光。好看舒服但是費(fèi)電,奢侈!”盧赫忍不住批判。
對(duì)方搖了搖頭,“這可不是日光燈,而是節(jié)能LED。藍(lán)色自發(fā)光材料的催化過(guò)程被攻克了,全光譜LED已經(jīng)開(kāi)始量產(chǎn)。即便維持能源現(xiàn)狀,以后所有人也都能擁有燈光自由?!?p> 盧赫不以為然地點(diǎn)了點(diǎn)頭。他對(duì)這些并不感冒,心里滿滿都是對(duì)7年倒計(jì)時(shí)的疑惑,“門口的標(biāo)語(yǔ)看到了吧,倒計(jì)時(shí)只有7年,為什么?”
對(duì)方把目光投在盧赫臉上,緩緩開(kāi)口:“因?yàn)槲覐淖詈笠淮伪痪庉?,到第一次發(fā)病,期間間隔了7年多。”
盧赫愣了一下,“我們的基因相似度大概還剩99.6%,你的現(xiàn)在是多少?”
“時(shí)間太久遠(yuǎn),我無(wú)法考究到我的原始基因組,我目前的基因組和時(shí)間間隔最久的一次,相似度是99.2%?!?p> “呦呵,那??偰V匕?,再過(guò)幾個(gè)月,你和最初的你說(shuō)不定就生殖隔離了!”
對(duì)方的臉上飄過(guò)一絲無(wú)奈,“我正好要找你,我們正在建立數(shù)據(jù)集,需要我盡可能多的基因組數(shù)據(jù)。2年前你跑到我公司揪下來(lái)的我的頭發(fā),還有沒(méi)有?”
盧赫轉(zhuǎn)了轉(zhuǎn)眼珠,“沒(méi)了,不過(guò)我可能還有測(cè)序結(jié)果,在我家里放著?!?p> “放哪里了,我讓人去取一下?!睂?duì)方語(yǔ)氣驚喜。
“沒(méi)必要?!北R赫回憶起往事,“我當(dāng)初從你頭發(fā)里提了三組基因,分別寄給三個(gè)公司測(cè)序,其中就有你們公司。你調(diào)下數(shù)據(jù)就行?!?p> “找過(guò)了,沒(méi)有??赡艽笸k姷臅r(shí)候,損失了?!?p> 盧赫無(wú)奈道:“我能先問(wèn)下你們目前是什么思路嗎?你要搞機(jī)器學(xué)習(xí)?那種不可解釋的黑箱,有用嗎?”
對(duì)方點(diǎn)頭認(rèn)可,“沒(méi)錯(cuò),我們就是要做機(jī)器學(xué)習(xí),而且是具備可解釋性的小樣本機(jī)器學(xué)習(xí)。至于你說(shuō)的黑箱,就算有些方法是黑箱,但好用就行了。
你們之前用的CRISPR脫靶分析軟件,其實(shí)就用了這種技術(shù)。那是巨硬亞洲研究院前幾年的成果。
他們建立了一個(gè)大型的數(shù)據(jù)集,記錄了與給定的向?qū)NA有一項(xiàng)核苷酸不匹配的所有可能的標(biāo)靶區(qū)域里發(fā)生的脫靶活動(dòng)。
然后把數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)兩個(gè)隱藏層的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),訓(xùn)練出了一個(gè)可以輸出所有潛在脫靶位點(diǎn)的模型。這是一個(gè)生成模型,可以得到每個(gè)脫靶位點(diǎn)的概率,據(jù)此計(jì)算脫靶評(píng)分。”
“太普通了,這只是實(shí)現(xiàn)了一個(gè)二線工具,還有沒(méi)有更驚艷的?”盧赫追問(wèn)。
“有。
非同源末端連接機(jī)制還記得吧?剪刀剪完基因序列后,不管三七二十一直接把斷裂的基因給粘起來(lái)。
這種方式并不常用,一般都是用同源模板修復(fù)。一方面是剪的時(shí)候可能剪了不止一個(gè)地方,粘的時(shí)候卻可能只粘了其中一個(gè)。另一方面是細(xì)胞不樂(lè)意了直接就不粘了。
但有團(tuán)隊(duì)利用機(jī)器學(xué)習(xí)算法準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)到了細(xì)胞容易修復(fù)的基因位點(diǎn),并用CRISPR和非同源末端連接治了病。
為了探索具有代表性的人類基因組序列的修復(fù)產(chǎn)物,他們?cè)O(shè)計(jì)了一千多個(gè)目標(biāo)位點(diǎn),特征是向?qū)NA和靶標(biāo)基因,標(biāo)簽是非同源末端連接最終起了修復(fù)作用位點(diǎn)。
數(shù)據(jù)喂給了一個(gè)看起來(lái)結(jié)構(gòu)很復(fù)雜的模型,訓(xùn)練結(jié)果很是喜人,模型對(duì)11%的向?qū)NA的修復(fù)位點(diǎn)的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率在50%以上。
意味著這些向?qū)NA和相應(yīng)靶標(biāo)基因所對(duì)應(yīng)的疾病,可以用這種方式來(lái)治療。
最終他們治愈了赫曼斯基-普德拉克綜合征,一種能凝血不足和白化病的遺傳病。體外測(cè)試的修復(fù)準(zhǔn)確率高達(dá)94%。
這個(gè)夠驚艷嗎?”
盧赫連連點(diǎn)頭,“夠。這個(gè)思路不錯(cuò),是不是可以用在你身上,特征是某時(shí)間點(diǎn)的基因組,標(biāo)簽是未來(lái)的變異位點(diǎn),提前預(yù)測(cè)變異,在發(fā)病前做修復(fù)?”
“沒(méi)錯(cuò)。”對(duì)方肯定道。
“可是這種方式,用在你一個(gè)人身上好說(shuō),其他人呢?萬(wàn)一我們未來(lái)都要跟你一樣,總不能每個(gè)人都建一個(gè)模型吧?”
“也不是不可以。不過(guò)還是希望未來(lái)有別的辦法。這個(gè)思路已經(jīng)被提上日程了,底下四層全是測(cè)序中心的地盤。”
盧赫露出了難以置信的表情,繼而又滿懷期待地追問(wèn),“也不對(duì)啊,我記得我當(dāng)初給你測(cè)序的時(shí)候,你突變的位點(diǎn)很多都在編碼區(qū)的。也許我們和你不一樣?!?p> “沒(méi)太大差別,前期確實(shí)大都在編碼區(qū),但后來(lái)也往非編碼區(qū)發(fā)展了。
非編碼區(qū)早就不是最初認(rèn)知中的“垃圾”區(qū),隨著研究的推進(jìn),它的重要作用也被逐漸揭示。之所以我年紀(jì)越大越嚴(yán)重,很可能就是因?yàn)楹笃谕蛔冊(cè)诹朔蔷幋a區(qū)。
很顯然,那里不是可以隨意落筆的空白畫(huà)布,而是地獄的入口,是禁區(qū)?!?p> 對(duì)方說(shuō)完,嘆了一口氣,便又開(kāi)始仰頭看燈,“我的測(cè)序結(jié)果放在你家哪里?得盡快派人去取,樣本本來(lái)就不多,數(shù)據(jù)很珍貴。”
“不用找別人,我自己去吧,我也不確定在不在,在哪里?!?p> 不一會(huì)兒,他又從鄭K手里弄到了車鑰匙,還收到了一連串的囑咐:
四通八達(dá)的隧道只限本市,去外市有一段路要走地上。
除了第110號(hào)掩體以外,其余的都還沒(méi)有下移動(dòng)通訊網(wǎng)絡(luò),沒(méi)法定位,需要熟記地圖。
這兩天天氣不錯(cuò),風(fēng)不大,能見(jiàn)度好,路上也沒(méi)人。但別開(kāi)太快,路面有沙子,滑。
出去之前,找后勤給車上加點(diǎn)配重。